Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSPC1Q8WXF1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSPC1Q8WXF1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSPC1Q8WXF1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSPC1Q8WXF1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSPC1Q8WXF1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PSPC1Q8WXF1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSPC1Q8WXF1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSPC1Q8WXF1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSPC1Q8WXF1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSPC1Q8WXF1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSPC1Q8WXF1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSPC1Q8WXF1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSPC1Q8WXF1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSPC1Q8WXF1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSPC1Q8WXF1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSPC1Q8WXF1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PSPC1Q8WXF1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSPC1Q8WXF1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSPC1Q8WXF1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSPC1Q8WXF1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSPC1Q8WXF1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSPC1Q8WXF1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSPC1Q8WXF1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSPC1Q8WXF1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PSPC1Q8WXF1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms