Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC12Q8WUD4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC12Q8WUD4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms