Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU68

U2AF1L4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L4Q8WU68 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
U2AF1L4Q8WU68 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms