Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG2

ACTRT1, Actin-related protein T1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT1Q8TDG2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTRT1Q8TDG2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTRT1Q8TDG2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms