Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM0

MCPH1, Microcephalin, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCPH1Q8NEM0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MCPH1Q8NEM0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MCPH1Q8NEM0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MCPH1Q8NEM0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MCPH1Q8NEM0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MCPH1Q8NEM0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MCPH1Q8NEM0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCPH1Q8NEM0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCPH1Q8NEM0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCPH1Q8NEM0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCPH1Q8NEM0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCPH1Q8NEM0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCPH1Q8NEM0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCPH1Q8NEM0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCPH1Q8NEM0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCPH1Q8NEM0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCPH1Q8NEM0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.6 ms