Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ZNF548Q8NEK5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF548Q8NEK5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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