Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IGSF1Q8N6C5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IGSF1Q8N6C5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IGSF1Q8N6C5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IGSF1Q8N6C5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IGSF1Q8N6C5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IGSF1Q8N6C5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IGSF1Q8N6C5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IGSF1Q8N6C5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
IGSF1Q8N6C5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IGSF1Q8N6C5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IGSF1Q8N6C5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
IGSF1Q8N6C5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IGSF1Q8N6C5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
IGSF1Q8N6C5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
IGSF1Q8N6C5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IGSF1Q8N6C5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IGSF1Q8N6C5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IGSF1Q8N6C5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IGSF1Q8N6C5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IGSF1Q8N6C5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IGSF1Q8N6C5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IGSF1Q8N6C5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IGSF1Q8N6C5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IGSF1Q8N6C5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IGSF1Q8N6C5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IGSF1Q8N6C5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IGSF1Q8N6C5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IGSF1Q8N6C5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
IGSF1Q8N6C5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
IGSF1Q8N6C5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
IGSF1Q8N6C5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
IGSF1Q8N6C5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
IGSF1Q8N6C5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
IGSF1Q8N6C5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IGSF1Q8N6C5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IGSF1Q8N6C5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IGSF1Q8N6C5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IGSF1Q8N6C5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IGSF1Q8N6C5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IGSF1Q8N6C5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
IGSF1Q8N6C5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IGSF1Q8N6C5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
IGSF1Q8N6C5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
IGSF1Q8N6C5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
IGSF1Q8N6C5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IGSF1Q8N6C5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IGSF1Q8N6C5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
IGSF1Q8N6C5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IGSF1Q8N6C5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IGSF1Q8N6C5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IGSF1Q8N6C5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IGSF1Q8N6C5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IGSF1Q8N6C5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IGSF1Q8N6C5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IGSF1Q8N6C5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
IGSF1Q8N6C5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IGSF1Q8N6C5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IGSF1Q8N6C5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms