Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC50Q8IVM0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC50Q8IVM0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms