Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUZ0

LRRC49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC49Q8IUZ0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC49Q8IUZ0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRRC49Q8IUZ0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRRC49Q8IUZ0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRRC49Q8IUZ0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC49Q8IUZ0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC49Q8IUZ0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC49Q8IUZ0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC49Q8IUZ0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC49Q8IUZ0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC49Q8IUZ0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC49Q8IUZ0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC49Q8IUZ0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC49Q8IUZ0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC49Q8IUZ0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC49Q8IUZ0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC49Q8IUZ0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC49Q8IUZ0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC49Q8IUZ0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms