Protein–RNA interactions for Protein: Q86WP2

GPBP1, Vasculin, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1Q86WP2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPBP1Q86WP2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPBP1Q86WP2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPBP1Q86WP2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPBP1Q86WP2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPBP1Q86WP2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPBP1Q86WP2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPBP1Q86WP2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPBP1Q86WP2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPBP1Q86WP2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPBP1Q86WP2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPBP1Q86WP2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPBP1Q86WP2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPBP1Q86WP2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPBP1Q86WP2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPBP1Q86WP2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPBP1Q86WP2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPBP1Q86WP2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms