Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PBRM1Q86U86 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.34
PBRM1Q86U86 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
PBRM1Q86U86 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
PBRM1Q86U86 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PBRM1Q86U86 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PBRM1Q86U86 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
PBRM1Q86U86 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
PBRM1Q86U86 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PBRM1Q86U86 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
PBRM1Q86U86 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PBRM1Q86U86 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PBRM1Q86U86 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PBRM1Q86U86 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PBRM1Q86U86 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PBRM1Q86U86 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PBRM1Q86U86 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PBRM1Q86U86 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PBRM1Q86U86 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PBRM1Q86U86 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
PBRM1Q86U86 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PBRM1Q86U86 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PBRM1Q86U86 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
PBRM1Q86U86 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
PBRM1Q86U86 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PBRM1Q86U86 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PBRM1Q86U86 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PBRM1Q86U86 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
PBRM1Q86U86 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
PBRM1Q86U86 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PBRM1Q86U86 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PBRM1Q86U86 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PBRM1Q86U86 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PBRM1Q86U86 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
PBRM1Q86U86 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
PBRM1Q86U86 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
PBRM1Q86U86 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PBRM1Q86U86 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PBRM1Q86U86 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
PBRM1Q86U86 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
PBRM1Q86U86 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
PBRM1Q86U86 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PBRM1Q86U86 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PBRM1Q86U86 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PBRM1Q86U86 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PBRM1Q86U86 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PBRM1Q86U86 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PBRM1Q86U86 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PBRM1Q86U86 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PBRM1Q86U86 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PBRM1Q86U86 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PBRM1Q86U86 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PBRM1Q86U86 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PBRM1Q86U86 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.33
PBRM1Q86U86 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
PBRM1Q86U86 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
PBRM1Q86U86 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PBRM1Q86U86 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PBRM1Q86U86 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PBRM1Q86U86 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PBRM1Q86U86 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
PBRM1Q86U86 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
PBRM1Q86U86 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
PBRM1Q86U86 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PBRM1Q86U86 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PBRM1Q86U86 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PBRM1Q86U86 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PBRM1Q86U86 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
PBRM1Q86U86 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
PBRM1Q86U86 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
PBRM1Q86U86 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
PBRM1Q86U86 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
PBRM1Q86U86 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PBRM1Q86U86 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
PBRM1Q86U86 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PBRM1Q86U86 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PBRM1Q86U86 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PBRM1Q86U86 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
PBRM1Q86U86 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
PBRM1Q86U86 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
PBRM1Q86U86 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC35.79■■■■□ 3.32
PBRM1Q86U86 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC35.79■■■■□ 3.32
PBRM1Q86U86 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PBRM1Q86U86 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PBRM1Q86U86 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
PBRM1Q86U86 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PBRM1Q86U86 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PBRM1Q86U86 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PBRM1Q86U86 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PBRM1Q86U86 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PBRM1Q86U86 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PBRM1Q86U86 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PBRM1Q86U86 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PBRM1Q86U86 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
PBRM1Q86U86 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
PBRM1Q86U86 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
PBRM1Q86U86 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
PBRM1Q86U86 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
PBRM1Q86U86 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
PBRM1Q86U86 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms