Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B1

NEGR1, Neuronal growth regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEGR1Q7Z3B1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEGR1Q7Z3B1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms