Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BBS12Q6ZW61 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BBS12Q6ZW61 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BBS12Q6ZW61 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms