Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUC0

TFAP2E, Transcription factor AP-2-epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2EQ6VUC0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TFAP2EQ6VUC0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TFAP2EQ6VUC0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TFAP2EQ6VUC0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TFAP2EQ6VUC0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms