Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF3

SCIMP, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCIMPQ6UWF3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SCIMPQ6UWF3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms