Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L8

SHC4, SHC-transforming protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC4Q6S5L8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHC4Q6S5L8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHC4Q6S5L8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHC4Q6S5L8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHC4Q6S5L8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHC4Q6S5L8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHC4Q6S5L8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHC4Q6S5L8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHC4Q6S5L8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHC4Q6S5L8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SHC4Q6S5L8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SHC4Q6S5L8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHC4Q6S5L8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SHC4Q6S5L8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHC4Q6S5L8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SHC4Q6S5L8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHC4Q6S5L8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHC4Q6S5L8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHC4Q6S5L8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHC4Q6S5L8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHC4Q6S5L8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHC4Q6S5L8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHC4Q6S5L8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHC4Q6S5L8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHC4Q6S5L8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHC4Q6S5L8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms