Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJF5

RHBDF2, Inactive rhomboid protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF2Q6PJF5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDF2Q6PJF5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms