Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TTC41PQ6P2S7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTC41PQ6P2S7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTC41PQ6P2S7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTC41PQ6P2S7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTC41PQ6P2S7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTC41PQ6P2S7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTC41PQ6P2S7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTC41PQ6P2S7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TTC41PQ6P2S7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTC41PQ6P2S7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTC41PQ6P2S7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTC41PQ6P2S7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTC41PQ6P2S7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTC41PQ6P2S7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTC41PQ6P2S7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTC41PQ6P2S7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTC41PQ6P2S7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTC41PQ6P2S7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTC41PQ6P2S7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTC41PQ6P2S7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTC41PQ6P2S7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTC41PQ6P2S7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTC41PQ6P2S7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TTC41PQ6P2S7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TTC41PQ6P2S7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TTC41PQ6P2S7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms