Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ89

DENND4C, DENN domain-containing protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND4CQ5VZ89 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DENND4CQ5VZ89 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENND4CQ5VZ89 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms