Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C1orf220Q5T0J3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1orf220Q5T0J3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms