Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
FRMPD1Q5SYB0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
FRMPD1Q5SYB0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
FRMPD1Q5SYB0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
FRMPD1Q5SYB0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
FRMPD1Q5SYB0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
FRMPD1Q5SYB0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
FRMPD1Q5SYB0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
FRMPD1Q5SYB0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC32.89■■■□□ 2.86
FRMPD1Q5SYB0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
FRMPD1Q5SYB0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
FRMPD1Q5SYB0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
FRMPD1Q5SYB0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
FRMPD1Q5SYB0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
FRMPD1Q5SYB0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
FRMPD1Q5SYB0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
FRMPD1Q5SYB0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
FRMPD1Q5SYB0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
FRMPD1Q5SYB0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
FRMPD1Q5SYB0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
FRMPD1Q5SYB0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
FRMPD1Q5SYB0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
FRMPD1Q5SYB0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
FRMPD1Q5SYB0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
FRMPD1Q5SYB0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
FRMPD1Q5SYB0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
FRMPD1Q5SYB0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
FRMPD1Q5SYB0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
FRMPD1Q5SYB0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
FRMPD1Q5SYB0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
FRMPD1Q5SYB0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
FRMPD1Q5SYB0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
FRMPD1Q5SYB0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
FRMPD1Q5SYB0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
FRMPD1Q5SYB0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
FRMPD1Q5SYB0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
FRMPD1Q5SYB0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
FRMPD1Q5SYB0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
FRMPD1Q5SYB0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
FRMPD1Q5SYB0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
FRMPD1Q5SYB0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
FRMPD1Q5SYB0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
FRMPD1Q5SYB0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC32.85■■■□□ 2.85
FRMPD1Q5SYB0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
FRMPD1Q5SYB0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
FRMPD1Q5SYB0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
FRMPD1Q5SYB0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
FRMPD1Q5SYB0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
FRMPD1Q5SYB0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
FRMPD1Q5SYB0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
FRMPD1Q5SYB0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
FRMPD1Q5SYB0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
FRMPD1Q5SYB0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
FRMPD1Q5SYB0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
FRMPD1Q5SYB0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
FRMPD1Q5SYB0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
FRMPD1Q5SYB0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
FRMPD1Q5SYB0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
FRMPD1Q5SYB0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC32.83■■■□□ 2.85
FRMPD1Q5SYB0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
FRMPD1Q5SYB0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
FRMPD1Q5SYB0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
FRMPD1Q5SYB0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
FRMPD1Q5SYB0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
FRMPD1Q5SYB0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
FRMPD1Q5SYB0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
FRMPD1Q5SYB0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
FRMPD1Q5SYB0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
FRMPD1Q5SYB0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
FRMPD1Q5SYB0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
FRMPD1Q5SYB0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
FRMPD1Q5SYB0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
FRMPD1Q5SYB0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
FRMPD1Q5SYB0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
FRMPD1Q5SYB0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
FRMPD1Q5SYB0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
FRMPD1Q5SYB0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
FRMPD1Q5SYB0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
FRMPD1Q5SYB0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
FRMPD1Q5SYB0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
FRMPD1Q5SYB0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
FRMPD1Q5SYB0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
FRMPD1Q5SYB0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
FRMPD1Q5SYB0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
FRMPD1Q5SYB0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
FRMPD1Q5SYB0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
FRMPD1Q5SYB0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
FRMPD1Q5SYB0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
FRMPD1Q5SYB0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC32.79■■■□□ 2.84
FRMPD1Q5SYB0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
FRMPD1Q5SYB0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
FRMPD1Q5SYB0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
FRMPD1Q5SYB0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
FRMPD1Q5SYB0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
FRMPD1Q5SYB0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
FRMPD1Q5SYB0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
FRMPD1Q5SYB0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC32.79■■■□□ 2.84
FRMPD1Q5SYB0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
FRMPD1Q5SYB0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
FRMPD1Q5SYB0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms