Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PITRM1Q5JRX3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms