Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC178Q5BJE1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms