Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HFEQ30201 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HFEQ30201 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HFEQ30201 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HFEQ30201 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HFEQ30201 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HFEQ30201 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HFEQ30201 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HFEQ30201 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HFEQ30201 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HFEQ30201 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HFEQ30201 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HFEQ30201 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HFEQ30201 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HFEQ30201 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HFEQ30201 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HFEQ30201 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HFEQ30201 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HFEQ30201 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HFEQ30201 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HFEQ30201 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HFEQ30201 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HFEQ30201 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HFEQ30201 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HFEQ30201 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HFEQ30201 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HFEQ30201 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HFEQ30201 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HFEQ30201 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HFEQ30201 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HFEQ30201 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HFEQ30201 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HFEQ30201 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HFEQ30201 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HFEQ30201 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HFEQ30201 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HFEQ30201 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HFEQ30201 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HFEQ30201 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HFEQ30201 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HFEQ30201 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HFEQ30201 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HFEQ30201 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HFEQ30201 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HFEQ30201 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HFEQ30201 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HFEQ30201 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HFEQ30201 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HFEQ30201 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HFEQ30201 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HFEQ30201 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HFEQ30201 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HFEQ30201 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HFEQ30201 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HFEQ30201 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HFEQ30201 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HFEQ30201 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HFEQ30201 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HFEQ30201 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HFEQ30201 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HFEQ30201 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HFEQ30201 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HFEQ30201 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HFEQ30201 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HFEQ30201 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HFEQ30201 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HFEQ30201 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HFEQ30201 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HFEQ30201 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HFEQ30201 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HFEQ30201 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HFEQ30201 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HFEQ30201 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HFEQ30201 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HFEQ30201 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HFEQ30201 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HFEQ30201 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HFEQ30201 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HFEQ30201 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HFEQ30201 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HFEQ30201 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HFEQ30201 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HFEQ30201 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HFEQ30201 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HFEQ30201 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HFEQ30201 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HFEQ30201 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HFEQ30201 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HFEQ30201 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HFEQ30201 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HFEQ30201 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HFEQ30201 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HFEQ30201 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HFEQ30201 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HFEQ30201 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HFEQ30201 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HFEQ30201 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HFEQ30201 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HFEQ30201 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HFEQ30201 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms