Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
FHOD3Q2V2M9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
FHOD3Q2V2M9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC34.41■■■■□ 3.1
FHOD3Q2V2M9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
FHOD3Q2V2M9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
FHOD3Q2V2M9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
FHOD3Q2V2M9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
FHOD3Q2V2M9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
FHOD3Q2V2M9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
FHOD3Q2V2M9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
FHOD3Q2V2M9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
FHOD3Q2V2M9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
FHOD3Q2V2M9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
FHOD3Q2V2M9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
FHOD3Q2V2M9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
FHOD3Q2V2M9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
FHOD3Q2V2M9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
FHOD3Q2V2M9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
FHOD3Q2V2M9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
FHOD3Q2V2M9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
FHOD3Q2V2M9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
FHOD3Q2V2M9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
FHOD3Q2V2M9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
FHOD3Q2V2M9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
FHOD3Q2V2M9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
FHOD3Q2V2M9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
FHOD3Q2V2M9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
FHOD3Q2V2M9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
FHOD3Q2V2M9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
FHOD3Q2V2M9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
FHOD3Q2V2M9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC34.38■■■■□ 3.09
FHOD3Q2V2M9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
FHOD3Q2V2M9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
FHOD3Q2V2M9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
FHOD3Q2V2M9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
FHOD3Q2V2M9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
FHOD3Q2V2M9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
FHOD3Q2V2M9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
FHOD3Q2V2M9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
FHOD3Q2V2M9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
FHOD3Q2V2M9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
FHOD3Q2V2M9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
FHOD3Q2V2M9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
FHOD3Q2V2M9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
FHOD3Q2V2M9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
FHOD3Q2V2M9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.37■■■■□ 3.09
FHOD3Q2V2M9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
FHOD3Q2V2M9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
FHOD3Q2V2M9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
FHOD3Q2V2M9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
FHOD3Q2V2M9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
FHOD3Q2V2M9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
FHOD3Q2V2M9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
FHOD3Q2V2M9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
FHOD3Q2V2M9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
FHOD3Q2V2M9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
FHOD3Q2V2M9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
FHOD3Q2V2M9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
FHOD3Q2V2M9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
FHOD3Q2V2M9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
FHOD3Q2V2M9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
FHOD3Q2V2M9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
FHOD3Q2V2M9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
FHOD3Q2V2M9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
FHOD3Q2V2M9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
FHOD3Q2V2M9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
FHOD3Q2V2M9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
FHOD3Q2V2M9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
FHOD3Q2V2M9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
FHOD3Q2V2M9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
FHOD3Q2V2M9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
FHOD3Q2V2M9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC34.33■■■■□ 3.09
FHOD3Q2V2M9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
FHOD3Q2V2M9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
FHOD3Q2V2M9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
FHOD3Q2V2M9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
FHOD3Q2V2M9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
FHOD3Q2V2M9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
FHOD3Q2V2M9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
FHOD3Q2V2M9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
FHOD3Q2V2M9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
FHOD3Q2V2M9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
FHOD3Q2V2M9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
FHOD3Q2V2M9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
FHOD3Q2V2M9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
FHOD3Q2V2M9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
FHOD3Q2V2M9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
FHOD3Q2V2M9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
FHOD3Q2V2M9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
FHOD3Q2V2M9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
FHOD3Q2V2M9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
FHOD3Q2V2M9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
FHOD3Q2V2M9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
FHOD3Q2V2M9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
FHOD3Q2V2M9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
FHOD3Q2V2M9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
FHOD3Q2V2M9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
FHOD3Q2V2M9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
FHOD3Q2V2M9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
FHOD3Q2V2M9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms