Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSR1Q2NL82 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSR1Q2NL82 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms