Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms