Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IMPG1Q17R60 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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