Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
ATP2B3Q16720 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP2B3Q16720 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP2B3Q16720 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP2B3Q16720 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP2B3Q16720 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP2B3Q16720 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP2B3Q16720 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP2B3Q16720 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP2B3Q16720 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP2B3Q16720 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP2B3Q16720 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP2B3Q16720 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP2B3Q16720 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP2B3Q16720 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP2B3Q16720 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP2B3Q16720 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP2B3Q16720 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP2B3Q16720 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP2B3Q16720 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP2B3Q16720 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP2B3Q16720 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP2B3Q16720 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP2B3Q16720 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP2B3Q16720 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP2B3Q16720 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP2B3Q16720 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP2B3Q16720 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP2B3Q16720 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP2B3Q16720 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP2B3Q16720 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP2B3Q16720 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP2B3Q16720 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP2B3Q16720 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP2B3Q16720 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP2B3Q16720 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP2B3Q16720 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP2B3Q16720 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP2B3Q16720 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP2B3Q16720 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP2B3Q16720 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
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