Protein–RNA interactions for Protein: Q16649

NFIL3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIL3Q16649 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFIL3Q16649 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
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NFIL3Q16649 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
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NFIL3Q16649 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
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NFIL3Q16649 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
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NFIL3Q16649 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
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NFIL3Q16649 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
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NFIL3Q16649 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFIL3Q16649 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
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