Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIK5Q16478 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIK5Q16478 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIK5Q16478 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIK5Q16478 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIK5Q16478 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIK5Q16478 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIK5Q16478 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIK5Q16478 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIK5Q16478 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIK5Q16478 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRIK5Q16478 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GRIK5Q16478 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRIK5Q16478 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
GRIK5Q16478 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GRIK5Q16478 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRIK5Q16478 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GRIK5Q16478 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GRIK5Q16478 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
GRIK5Q16478 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
GRIK5Q16478 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GRIK5Q16478 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRIK5Q16478 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GRIK5Q16478 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GRIK5Q16478 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRIK5Q16478 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRIK5Q16478 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRIK5Q16478 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIK5Q16478 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIK5Q16478 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIK5Q16478 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIK5Q16478 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIK5Q16478 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIK5Q16478 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIK5Q16478 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIK5Q16478 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIK5Q16478 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIK5Q16478 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIK5Q16478 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIK5Q16478 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIK5Q16478 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIK5Q16478 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIK5Q16478 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIK5Q16478 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIK5Q16478 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
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