Protein–RNA interactions for Protein: Q15459

SF3A1, Splicing factor 3A subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A1Q15459 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SF3A1Q15459 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SF3A1Q15459 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SF3A1Q15459 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SF3A1Q15459 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SF3A1Q15459 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SF3A1Q15459 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SF3A1Q15459 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SF3A1Q15459 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SF3A1Q15459 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SF3A1Q15459 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SF3A1Q15459 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SF3A1Q15459 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SF3A1Q15459 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SF3A1Q15459 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SF3A1Q15459 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SF3A1Q15459 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SF3A1Q15459 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SF3A1Q15459 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SF3A1Q15459 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SF3A1Q15459 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SF3A1Q15459 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SF3A1Q15459 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SF3A1Q15459 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
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