Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
UBE3CQ15386 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE3CQ15386 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
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