Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NR1I3Q14994 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NR1I3Q14994 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
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