Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
DNASE1L3Q13609 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNASE1L3Q13609 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNASE1L3Q13609 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNASE1L3Q13609 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNASE1L3Q13609 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNASE1L3Q13609 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNASE1L3Q13609 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNASE1L3Q13609 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
DNASE1L3Q13609 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNASE1L3Q13609 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms