Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PEX6Q13608 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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PEX6Q13608 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PEX6Q13608 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
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