Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TCIRG1Q13488 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TCIRG1Q13488 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TCIRG1Q13488 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
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