Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MSLNQ13421 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MSLNQ13421 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
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