Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERCC8Q13216 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERCC8Q13216 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERCC8Q13216 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERCC8Q13216 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERCC8Q13216 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERCC8Q13216 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERCC8Q13216 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERCC8Q13216 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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ERCC8Q13216 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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ERCC8Q13216 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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ERCC8Q13216 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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ERCC8Q13216 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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ERCC8Q13216 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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ERCC8Q13216 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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ERCC8Q13216 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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ERCC8Q13216 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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