Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC16Q13042 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CDC16Q13042 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDC16Q13042 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDC16Q13042 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDC16Q13042 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDC16Q13042 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDC16Q13042 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDC16Q13042 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDC16Q13042 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDC16Q13042 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDC16Q13042 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDC16Q13042 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDC16Q13042 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CDC16Q13042 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms