Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CNTN1Q12860 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNTN1Q12860 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
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