Protein–RNA interactions for Protein: Q12129

NMD4, Nonsense-mediated decay protein 4, yeastyeast

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD4Q12129 CUE3YGL110C 1875 nt3.95□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 PGS1YCL004W 1566 nt3.95□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 GYP6YJL044C 1377 nt3.95□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 YIG1YPL201C 1386 nt3.95□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 SNU23YDL098C 585 nt3.95□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 CPR1YDR155C 489 nt3.95□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 BUD25YER014C-A 462 nt3.95□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 YGL138CYGL138C 1038 nt3.95□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 BIO2YGR286C 1128 nt3.95□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 GTT1YIR038C 705 nt3.95□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 DSS4YPR017C 432 nt3.95□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 OAF3YKR064W 2592 nt3.95□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 DAP2YHR028C 2457 nt3.95□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 SLI1YGR212W 1407 nt3.95□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 ACK1YDL203C 1872 nt3.94□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 TSC13YDL015C 933 nt3.94□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 SOL4YGR248W 768 nt3.94□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 RPS4BYHR203C 786 nt3.94□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt3.94□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 RPS4AYJR145C 786 nt3.94□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 YLR157W-DYLR157W-D 213 nt3.94□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 YBL062WYBL062W 381 nt3.94□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 UFE1YOR075W 1041 nt3.94□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 YNR065CYNR065C 3351 nt3.94□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 EMP47YFL048C 1338 nt3.94□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 YJR038CYJR038C 363 nt3.93□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 YJR128WYJR128W 360 nt3.93□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 YAR075WYAR075W 474 nt3.93□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 TRM112YNR046W 408 nt3.93□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 REX4YOL080C 870 nt3.93□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 DDP1YOR163W 567 nt3.93□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 GAL11YOL051W 3246 nt3.93□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 RSC58YLR033W 1509 nt3.93□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 VHS3YOR054C 2025 nt3.93□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 MAK11YKL021C 1407 nt3.93□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 DIP2YLR129W 2832 nt3.93□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 YHR202WYHR202W 1809 nt3.93□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 SUP45YBR143C 1314 nt3.93□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 NTH1YDR001C 2256 nt3.92□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 TAF8YML114C 1533 nt3.92□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 SST2YLR452C 2097 nt3.92□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 ELO2YCR034W 1044 nt3.92□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 YDR246W-AYDR246W-A 201 nt3.92□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 HIM1YDR317W 1245 nt3.92□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 PEX14YGL153W 1026 nt3.92□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 YBL010CYBL010C 843 nt3.92□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 SIW14YNL032W 846 nt3.92□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 YNL319WYNL319W 441 nt3.92□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 APA1YCL050C 966 nt3.92□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 KIN2YLR096W 3444 nt3.92□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 FAS2YPL231W 5664 nt3.92□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 PBI1YPL272C 1554 nt3.92□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 VPS73YGL104C 1461 nt3.92□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 RRN7YJL025W 1545 nt3.91□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 YGL088WYGL088W 366 nt3.91□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 LSB1YGR136W 726 nt3.91□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 CUP1-1YHR053C 186 nt3.91□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 CUP1-2YHR055C 186 nt3.91□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 CAP2YIL034C 864 nt3.91□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 POL32YJR043C 1053 nt3.91□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 VPS25YJR102C 609 nt3.91□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 RPL14AYKL006W 417 nt3.91□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 YMR310CYMR310C 954 nt3.91□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 YNL181WYNL181W 1224 nt3.91□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 SLS1YLR139C 1932 nt3.91□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 ORC4YPR162C 1590 nt3.9□□□□□ -1.78
NMD4Q12129 MEI4YER044C-A 1227 nt3.9□□□□□ -1.79
NMD4Q12129 RTA1YGR213C 954 nt3.9□□□□□ -1.79
NMD4Q12129 RPL8AYHL033C 771 nt3.9□□□□□ -1.79
NMD4Q12129 YLR169WYLR169W 354 nt3.9□□□□□ -1.79
NMD4Q12129 YLR365WYLR365W 333 nt3.9□□□□□ -1.79
NMD4Q12129 RPL18BYNL301C 561 nt3.9□□□□□ -1.79
NMD4Q12129 RPL18AYOL120C 561 nt3.9□□□□□ -1.79
NMD4Q12129 YOR082CYOR082C 342 nt3.9□□□□□ -1.79
NMD4Q12129 snR44snR44 211 nt3.9□□□□□ -1.79
NMD4Q12129 FUN12YAL035W 3009 nt3.9□□□□□ -1.79
NMD4Q12129 YOL019WYOL019W 1656 nt3.9□□□□□ -1.79
NMD4Q12129 PRM15YMR278W 1869 nt3.9□□□□□ -1.79
NMD4Q12129 PIM1YBL022C 3402 nt3.89□□□□□ -1.79
NMD4Q12129 ECM22YLR228C 2445 nt3.89□□□□□ -1.79
NMD4Q12129 YDL157CYDL157C 357 nt3.89□□□□□ -1.79
NMD4Q12129 YDR535CYDR535C 501 nt3.89□□□□□ -1.79
NMD4Q12129 RPS25AYGR027C 327 nt3.89□□□□□ -1.79
NMD4Q12129 PSF2YJL072C 642 nt3.89□□□□□ -1.79
NMD4Q12129 MET14YKL001C 609 nt3.89□□□□□ -1.79
NMD4Q12129 MRPL3YMR024W 1173 nt3.89□□□□□ -1.79
NMD4Q12129 YNL226WYNL226W 411 nt3.89□□□□□ -1.79
NMD4Q12129 YOR131CYOR131C 657 nt3.89□□□□□ -1.79
NMD4Q12129 IDH2YOR136W 1110 nt3.89□□□□□ -1.79
NMD4Q12129 TPA1YER049W 1935 nt3.89□□□□□ -1.79
NMD4Q12129 NOC2YOR206W 2133 nt3.88□□□□□ -1.79
NMD4Q12129 SSH1YBR283C 1473 nt3.88□□□□□ -1.79
NMD4Q12129 AIM7YDR063W 450 nt3.88□□□□□ -1.79
NMD4Q12129 SPC19YDR201W 498 nt3.88□□□□□ -1.79
NMD4Q12129 IRC18YJL037W 675 nt3.88□□□□□ -1.79
NMD4Q12129 CMC1YKL137W 336 nt3.88□□□□□ -1.79
NMD4Q12129 YAL064WYAL064W 285 nt3.88□□□□□ -1.79
NMD4Q12129 HNT3YOR258W 654 nt3.88□□□□□ -1.79
NMD4Q12129 ATG2YNL242W 4779 nt3.88□□□□□ -1.79
NMD4Q12129 YDR131CYDR131C 1671 nt3.87□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.1 ms