Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CGNL1Q0VF96 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CGNL1Q0VF96 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CGNL1Q0VF96 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CGNL1Q0VF96 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CGNL1Q0VF96 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CGNL1Q0VF96 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CGNL1Q0VF96 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CGNL1Q0VF96 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CGNL1Q0VF96 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CGNL1Q0VF96 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CGNL1Q0VF96 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CGNL1Q0VF96 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CGNL1Q0VF96 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CGNL1Q0VF96 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CGNL1Q0VF96 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CGNL1Q0VF96 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CGNL1Q0VF96 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms