Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRKCDQ05655 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRKCDQ05655 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms