Protein–RNA interactions for Protein: Q02962

PAX2, Paired box protein Pax-2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX2Q02962 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAX2Q02962 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PAX2Q02962 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAX2Q02962 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAX2Q02962 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAX2Q02962 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAX2Q02962 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAX2Q02962 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAX2Q02962 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAX2Q02962 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAX2Q02962 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAX2Q02962 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAX2Q02962 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAX2Q02962 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAX2Q02962 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAX2Q02962 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAX2Q02962 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAX2Q02962 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAX2Q02962 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAX2Q02962 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAX2Q02962 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAX2Q02962 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAX2Q02962 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAX2Q02962 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAX2Q02962 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAX2Q02962 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAX2Q02962 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAX2Q02962 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAX2Q02962 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAX2Q02962 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAX2Q02962 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAX2Q02962 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAX2Q02962 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PAX2Q02962 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAX2Q02962 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAX2Q02962 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAX2Q02962 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAX2Q02962 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAX2Q02962 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PAX2Q02962 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAX2Q02962 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAX2Q02962 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms