Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TNFRSF17Q02223 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TNFRSF17Q02223 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms