Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
CLTCQ00610 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC31.84■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CLTCQ00610 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CLTCQ00610 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
CLTCQ00610 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms