Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NOMO3P69849 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NOMO3P69849 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NOMO3P69849 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NOMO3P69849 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NOMO3P69849 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NOMO3P69849 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NOMO3P69849 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NOMO3P69849 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NOMO3P69849 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NOMO3P69849 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NOMO3P69849 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOMO3P69849 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms