Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP46P62068 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP46P62068 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP46P62068 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP46P62068 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
USP46P62068 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
USP46P62068 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
USP46P62068 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP46P62068 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP46P62068 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP46P62068 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP46P62068 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP46P62068 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP46P62068 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP46P62068 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP46P62068 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP46P62068 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP46P62068 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP46P62068 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP46P62068 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP46P62068 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP46P62068 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP46P62068 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP46P62068 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP46P62068 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP46P62068 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP46P62068 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP46P62068 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP46P62068 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP46P62068 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP46P62068 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP46P62068 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP46P62068 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP46P62068 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP46P62068 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP46P62068 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP46P62068 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP46P62068 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP46P62068 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP46P62068 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP46P62068 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP46P62068 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP46P62068 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP46P62068 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP46P62068 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP46P62068 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP46P62068 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP46P62068 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP46P62068 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP46P62068 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP46P62068 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP46P62068 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP46P62068 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP46P62068 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP46P62068 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP46P62068 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP46P62068 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP46P62068 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP46P62068 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP46P62068 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP46P62068 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP46P62068 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
USP46P62068 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP46P62068 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP46P62068 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP46P62068 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP46P62068 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP46P62068 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP46P62068 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP46P62068 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP46P62068 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP46P62068 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP46P62068 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP46P62068 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP46P62068 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP46P62068 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP46P62068 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP46P62068 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP46P62068 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP46P62068 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP46P62068 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP46P62068 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
USP46P62068 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP46P62068 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP46P62068 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP46P62068 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP46P62068 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP46P62068 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP46P62068 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP46P62068 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP46P62068 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP46P62068 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
USP46P62068 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP46P62068 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP46P62068 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
USP46P62068 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
USP46P62068 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP46P62068 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP46P62068 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP46P62068 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms