Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVFRD-1P60508 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms